TS Vũ Quảng lưu ý rằng cần có sự chỉ đạo sát sao và sự phối hợp đồng bộ giữa các bên liên quan nhằm tránh những tác động ngoài mong muốn. Trong đó, đáng lo ngại nhất là nguy cơ làm mất đi tính đặc thù và sự linh hoạt vốn có của Đại học Quốc gia, từ đó ảnh hưởng đến quyền tự chủ đại học.

Bên cạnh đó, các vấn đề liên quan đến ngân sách và thủ tục hành chính cũng cần được xử lý kịp thời, nhằm đảm bảo hiệu quả hoạt động của hai đại học đặc thù này không bị suy giảm.